Кафедра систем автоматизированного проектирования (САПР) была создана в 1984г. на базе сектора САПР вычислительного центра университета. В 1985 году сектор САПР вошел в состав новой кафедры как научное подразделение.

Основателем и первым заведующим кафедрой является доктор технических наук, профессор Белов Владимир Федорович. В настоящее время кафедрой заведует кандидат технических наук доцент Шамаев Алексей Валентинович.

Первыми преподавателями кафедры были:

1. Румянцев Анатолий Александрович (1985 – 1986 гг.)

2. Чертанов Геннадий Иванович (1985 – 1988 гг.)

3. Кочугаев Петр Николаевич (1985 – 1986 гг.)

4. Шабанов Геннадий Иванович (1985 г. – по настоящее время)

В разное время на кафедре работали: Абрамов Ю.А., Матявин С.А., Левин А.В., канд. т.ехн. наук Кустов М.В., канд. т.ехн. наук Волков Ю.Д., канд. т.ехн. наук Фоминов А.Г., Стукалов В.Н., канд. т.ехн. наук Еникеев О.А., канд. т.ехн. наук Монтвелишский М.Б., канд. т.ехн. наук Мелешкин А.С., канд. т.ехн. наук Зазыгин П.В., канд. т.ехн. наук Аболемов Е.Н., Уткина Л.В., канд. физ.-мат. наук Логинов Д.В., канд. физ.-мат. наук Белов И.В., канд. физ.-мат. наук Борисов М.А., канд. физ.-мат. наук Попов А.В.

В настоящее время на кафедре работают 2 доктора наук, профессора; 10 кандидатов наук, доцентов (включая 2 внешних и 1 внутреннего совместителя); 5 преподавателей (включая 3 внешних совместителей и 1 внутреннего совместителя), 1 ведущий математик и 2 программиста.

Кафедра ведет учебную работу в 5 институтах и на 2 факультетах по 23 направлениям подготовки и специальностям. С 2012 года кафедра является выпускающей по направлению подготовки 09.03.04 Программная инженерия (уровень бакалавриата), а с 2017 - также по направлению подготовки 09.04.04 Программная инженерия (уровень магистратуры).

Профессора кафедры ведут подготовку научных и научно-педагогических кадров в аспирантуре по научной специальности 1.2.2 Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ.

На кафедре выполнены и защищены 2 докторские и 5 кандидатских диссертаций, изданы 4 монографии. Кафедра активно развивает связи с производством, ведет международную деятельность.

Преподаватели, программисты, аспиранты и студенты, работающие и проходящие обучение на кафедре являются исполнителями контрактов на НИОКР, выполняемых на предприятиях, специализирующихся на производстве программного обеспечения Республики Мордовия.