Научно-исследовательский институт экологии создан в 1994 году с целью осуществления фундаментальных и прикладных исследований по проблемам экологии и природопользования, обеспечения экологической безопасности населения и устойчивого природно-социально-экономического развития Республики Мордовия.
Первым директором НИИ экологии был доктор географических наук, профессор Сергей Петрович Евдокимов. В 1999 г. его сменил на этом посту кандидат географических наук, доцент Виктор Николаевич Маскайкин, с 2005 г. по сентябрь 2011 г. институт возглавлял кандидат географических наук, профессор Вячеслав Петрович Ковшов. В настоящее время директором НИИ экологии является кандидат географических наук, доцент Александр Владимирович Кирюшин.
Заместителем директора НИИ экологии является Маскайкин Виктор Николаевич.
Работа НИИ экологии осуществляется на общественных началах, основные источники финансирования — хоздоговорные работы по профилю НИИ экологии.
Главными задачами НИИ экологии являются:
- оценка природно-ресурсного потенциала Республики Мордовия;
- научно-исследовательские работы по экологическому мониторингу природно-социально-производственных систем Республики Мордовия;
- научно-техническое обоснование природоохранной проектной документации;
- участие во внедрении результатов научных исследований и разработок в практическую деятельность;
- привлечение преподавателей, аспирантов и студентов к научно-исследовательской работе, выполняемой в НИИ экологии;
- разработка и реализация дополнительных профессиональных программ по обеспечению экологической безопасности, охране окружающей среды
- проводит научные исследования, а также опытные, конструкторские и технологические разработки в области экологии и природопользования для устойчивого развития региона и обеспечения экологической безопасности;
- обеспечивает широкое использование передовых достижений отечественной и мировой науки и техники, наиболее полное и своевременное использование в своей деятельности современных научно-информационных источников;
- выполняет научно-исследовательские и прикладные работы по мониторингу и охране окружающей среды, изучению природно-ресурсного потенциала Мордовии на основе хозяйственных договоров;
- привлекает профессорско-преподавательский состав соответствующих кафедр и факультетов (институтов) Университета к выполнению научных исследований;
- совместно с факультетом дополнительного образования Университета ведет подготовку и реализацию дополнительных профессиональных программ по обеспечению экологической безопасности, охране окружающей среды;
- оказывает помощь кафедрам и другим подразделениям Университета в проведении научных разработок по профилю НИИ экологии;
- предоставляет материально-техническую базу студентам и аспирантам для проведения научных исследований, в том числе для выполнения выпускных квалификационных работ, связанных с научными исследованиями по тематике НИИ экологии и проведения исследований, выполняемых во время прохождения студентами и магистрантами производственных практик.
В последние несколько лет работа НИИ экологии успешно развивается по следующим основным направлениям:
1) Научно-исследовательская и прикладная работа в области экологического мониторинга, охраны окружающей среды, изучения природно-ресурсного потенциала Мордовии на основе хозяйственных договоров. Основная тематика научных работ связана с изучением минерально-сырьевой базы Республики Мордовия; с оценкой современного состояния геологической среды и ее взаимодействия с объектами техногенного характера, влиянием различных промышленных объектов на качество поверхностных и подземных вод; с изучением опасных экзогенно-геологических процессов в инженерно-геологических целях. В ходе многолетней работы обобщены и представлены в цифровом виде базы данных о результатах изучения геологического строения, водоснабжения, недропользования, состояния минерально-сырьевой базы территории Мордовии. Особо можно отметить многолетние исследования состояния окружающей среды и мониторинг ее загрязнения на территории шламонакопителя Саранской ТЭЦ-2, исследование и мониторинг подземных вод по Саранской ТЭЦ-2 в районе шламонакопителя (рук х/д Маскайкин В. Н. и Масляев В. Н).
2) Одним из важнейших направлений деятельности НИИ экологии являются работы, связанные с научно-техническим обоснованием проектной документации в области охраны окружающей среды. За последние годы проекты нормативов предельно-допустимых выбросов, нормативов образования отходов и лимитов на их размещение, проекты СЗЗ были подготовлены более чем для 100 предприятий и организаций республики.
3) В последние 20 лет в НИИ экологии успешно реализовывалась система непрерывного экологического образования. Реализуются следующие программы повышения квалификации: — «Охрана окружающей среды и обеспечение экологической безопасности» (72 академических часа); - «Обеспечение экологической безопасности руководителями и специалистами экологических служб и систем экологического контроля» (180 академических часов); - «Деятельность в области сбора, транспортирования, обработки, утилизации, обезвреживания, размещения отходов I-IV классов опасности» (38 часов).
4) За последние годы период НИИ экологии стала одной из основных баз прохождения производственных практик для бакалавров и магистрантов для направления подготовки «Экология и природопользования». Также на базе НИИ экологии проходят практику некоторые бакалавры и магистры по направлению подготовки «География». Также на базе НИИ экологии осуществляется научно-исследовательская работа магистрантов направления «Экология и природопользование», основой для проведения научно-исследовательских работ являются научно-технические и фондовые материалы, накопленные в результате выполнения х/д работ.