Институт ведет активную научно-исследовательскую деятельность. Успешно функционируют, признанные в России и за рубежом, 2 научно-педагогические школы профессоров Н.И. Бояркина «Финно-угорское (мордовское) музыкальное искусство» и Н.И. Ворониной «Интеллектуальные и эстетические ценности российской провинции».      В институте действуют аспирантура и докторантура. Функционирует докторский диссертационный совет Д 212. 117. 10 (за время работы диссертационного совета защищено 125 диссертаций, из них 13 докторских и 112 кандидатских по специальности 24.00.01 – Теория и история культуры (философские науки, культурология, искусствоведение). Тематика диссертационных исследовательских работ:  финно-угорская (а также мордовская) мифология, полиэтнический город, финно-угорское музыкальное искусство, музыкальная культура народов России, этнофутуризм в изобразительном искусстве Мордовии, Мари-Эл, Коми и др., танцевальная пластика мордвы, фолк-танец как феномен современного танцевального искусства, история театральной культуры, финно-угорское декоративно-прикладное творчество, творчество С.Д. Эрьзи и Ф.В. Сычкова и мн. др.      Преподаватели и аспиранты института проходят научные стажировки в ведущих российских и зарубежных вузах: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Казанский (Приволжский) федеральный университет, Будапештский университет им. Лоранда Этвеша (Венгрия), Католический университет им. П. Пазманя (Венгрия), Дюссельдорфский университет им. Г. Гейне (Германия) и др.      Большое внимание уделяется привлечению студентов к научно-исследовательской работе. Функционируют Студенческое научное общество (рук. – доц. О.Н. Прокаева), 12 научных кружков. Издается ежегодник студенческих научных статей «Од вайгель». Студенты института принимали участие в Международной конференции студентов-финноугроведов IFUSCO (г. Хельсинки, Финляндия, 2008; г. Будапешт, Венгрия, 2011), Международной научно-практической конференции «Экология традиционной культуры и современного искусства» (г. Саранск, 2009), Международной научно-практической конференции «Регион: культура в поиске самоидентичности» (г. Саранск, 2009) и др.       В целях интеграции в мировое научно-образовательное пространство институт сотрудничает с научно-исследовательскими институтами, научными центрами, творческими союзами  и культурно-просветительскими организациями Финляндии (Академия им. Я. Сибелиуса, Консерватория Куопио, отделение этномузыкологии Хельсинского и Ювяскюльского университетов, Университетом прикладных наук Северной Карелии, Центр (институт) мировой музыки, Общество М. Кастрена, Общество «Калевала»), Эстонии (Академия музыки и театра, Академия культуры Тартуского университета, Общество «Fenno-Ugria»), Венгрии (Институт музыкознания Венгрии, Консерватория им. Б. Бартока, Университет им. Лоранда Этвеша, Католический университет им. П. Пазманя),  Белоруссии (ГНУ «Институт искусствоведения, этнографии и фольклора им. Кондрата Крапивы Национальной академии наук Беларуси»), Германии (Дюссельдорфский университет им. Г. Гейне) и др.      Институтом выиграны гранты международных программ и фондов: – грант Clobal Musik Centra на поездку в Хельсинки для работы над изданием звукозаписей мордовской народной музыки в CD, фонограммархивах финского радио, Clobal Musik Centra, Литературного музея, Финно-угорского общества (Финляндия); – грант Ассоциации финно-угорских народов России на издание сборника научных трудов «Финно-угорские музыкальные традиции в контексте межэтнических отношений»; – грант Эстонской музыкальной академии и Международного общества «Fenno-Ugria» на участие в Международном фестивале «Музыка финно-угорских народов» и Международной конференции «Финно-угорское вокальное многоголосие в контексте балтийских и славянских музыкальных культур» (Эстония); – грант Отделения  этномузыкологии  Академии  наук  Эстонии  на  поездку  преподавателей  кафедры  народной  музыки  на  Международную  конференцию  «Individual and Collective in Traditional Culture» (Эстония); – грант Global Music Centre на поездку в г. Иматра (Финляндия) для участия в конференции и фестивале «Ugriuhla» и презентации CD-дисков «Syulgam»; – грант Академии Сибелиуса (Финляндия) на участие в Международном научно-творческом фестивале «Yutajaiset».      На базе ИНК  функционирует сектор культуры (рук. – проф. Н.И. Бояркин) Межрегионального научного Центра финно-угроведения МГУ им. Н.П. Огарева. В настоящее время здесь разрабатываются и реализуются проекты, направленные на решение важных интеграционных задач научного характера: изучение и осмысление социального, национального и конфессионального многообразия финно-угорской диаспоры в культурном пространстве регионов; подготовка монографий по различным проблемам финно-угорской культуры;  внедрение теоретических знаний и профессиональных навыков в практику живого исполнительства (постановка хореографических и драматических спектаклей, открытие  выставок декоративно-прикладного творчества и  изобразительного искусства; показ сольных и ансамблевых музыкальных концертных программ; применение художественных технологий при создании изделий народно-художественного творчества); издание международного научного журнала «Финно-угорский мир».      В   рамках   реализации  мероприятий  Программы  развития  НИУ ФГБОУВ ПО «МГУ им. Н. П. Огарева» по приоритетному направлению развития «Фундаментальные и прикладные исследования в области финно-угроведения» (ПНР-2) создана Научно-исследовательская лаборатория финно-угорской культуры (зав. – доц. Е.Н. Ломшина). Основным видом деятельности лаборатории является проведение фундаментальных и прикладных финно-угроведческих исследований по приоритетным направлениям деятельности Института национальной культуры: «Традиционная мордовская народная инструментальная музыка: органология, стилистика, межэтнические контексты»; «Национальный финно-угорский костюм: общеэтнические традиции и регио-нальная специфика»; «Традиционное декоративно-прикладное искусство мордвы в контексте современных культурных практик финно-угорских народов»; «Нравственная культура финно-угорских народов: традиции и инновации»; «Хореографическое искусство финно-угорских народов: сопоставительный анализ» и др. Особое внимание уделятся методологическому и методическому обеспечению образовательных программ специалитета, бакалавриата и магистратуры, направленных на подготовку и переподготовку специалистов в области финно-угроведения. Осуществляется работа по формированию информационно-телекоммуникационной системы генерации и распространения знаний, а также их трансферта в области создания прорывных технологий и наукоемких продуктов финно-угорского мира; интеграции в современную университетскую инфраструктуру и информационной поддержке внутригосударственных и международных контактов университета на основе институционализации связей с финно-угорским сообществом.    В институте создан сектор мультимедиаресурсов Информационно-ресурсного центра (ИРЦ) «Наследие финно-угорских народов», позволяющий сохранять и изучать исторические и культурные информационные объекты финно-угорской тематики, увеличить доступность информации по финно-угорской тематике и популяризировать ее среди населения, а также стимулировать информационное взаимодействие пользователей единой информационной среды университета. В рамках проекта создано электронное хранилище, электронный каталог информационных ресурсов и разработано портальное решение для доступа к ресурсам хранилища внешних пользователей. Кроме того, оснащаются центры коллективного пользования по обработке и оцифровке полнотекстовых документов, мультимедиа материалов и студии аудио- и видеозаписи, учебно-демонстрационных комнат, которые используются в учебном процессе (для проведения учебных занятий) и в научно-исследовательской деятельности (проведение презентаций, конференций, симпозиумов и т.п.). Запущен в эксплуатацию программно-аппаратный комплекс, предназначенный для обработки, сохранности и изучения объектов наследия финно-угорских народов в соответствии с современным уровнем технологий и научных знаний. Комплекс организационных мероприятий позволит включить ИРЦ в образовательную, научно-исследовательскую и культурную деятельность университета.