В 1975 году на факультете механизации сельского хозяйства образована кафедра механизации и автоматизации животноводческих комплексов, которую возглавил кандидат технических наук Ю.А. Вантюсов. В 1983 году кафедра реорганизована в кафедру электрификации и автоматизации с./х. производства. Спустя три года на ее базе организована кафедра механизации животноводства, которую возглавил кандидат технических наук, доцент И.Н. Босин (1986−1991).

В связи с открытием в университете специальностей «Биотехнология» и «Механизация переработки сельскохозяйственной продукции» кафедра переименована сначала в кафедру «Механизации животноводства и переработки сельскохозяйственной продукции» (зав. кафедрой кандидат технических наук, доцент В. И. Лафуткин (1989−1999)), а в 1998 году она получила нынешнее название, и ее возглавил доктор технических наук, профессор А.В. Котин. С 2019 по 2024 года кафедру возглавлял кандидат технических наук, доцент В.В. Кузнецов. С сентября 2024 года временно исполняющим заведующего кафедрой назначен кандидат технических наук А. М. Кузьмин.

Кафедра выпускает бакалавров и магистров профилей «Машины и оборудование для хранения и переработки сельскохозяйственной продукции» и «Проектирование, эксплуатация и ремонт технических систем и комплексов» направления «Агроинженерия».

В настоящее время на кафедре работает 9 преподавателей, из них 1 доктор технических наук, профессор (Котин А.В.), 8 кандидатов технических наук, доцентов (Кузнецов В.В., Березин М. А., Борисов В. И., Бутяйкин В. В., Кувшинова О. А., Кузьмин А. М., Конаков А. В., Радайкина Е.А.), которые проводят занятия со студентами института механики и энергетики, аграрного института, биологического факультета, института физики и химии.

Кафедра формирует у студентов компетенции в области проектирования, монтажа, эксплуатации и ремонта технологического оборудования для хранения и переработки продукции АПК, процессов и аппаратов перерабатывающих производств, техники и технологий животноводства, методов и технических средств для контроля качества технологических процессов переработки с./х. продукции и др.

Потенциальные работодатели наших выпускников — это ведущие промышленные перерабатывающие предприятия России и Мордовии, такие как ГК «Талина», АО «Данон Россия», Агрогруппа «Хорошее дело», ОАО «САН ИнБев», ОАО «Консервный завод «Саранский», АО «Агрофирма 'Октябрьская', ОАО «Мясокомбинат «Оброченский», ЗАО «Птицефабрика Атемарская', АО «Хлебозавод», а также крупные предприятия-производители сельскохозяйственной продукции. Компетенции наших выпускников позволяют им также успешно реализовать себя на предприятиях, специализирующихся в области разработки и поставки зарубежного и отечественного технологического оборудования для переработки сырья и материалов различного назначения — Alfa Laval, GEA, HAAKE и других.

Научные исследования и учебные занятия проводятся на современном высокотехнологичном оборудовании лаборатории энергоресурсосберегающих технологий переработки сырья и материалов, входящей в состав кафедры.