Русское географическое общество за исследования в области этнографии, антропологии, исторической географии, культурного наследия наградило профессора Николая Федоровича Мокшина Золотой медалью имени Николая Николаевича Миклухо-Маклая.
Н. Ф. Мокшин на протяжении более 30 лет руководил этнографическими экспедициями Мордовского государственного университета. В процессе полевых и камеральных работ ученый исследовал многие актуальные проблемы этногенеза и этнической истории мордовского народа, его общественного строя, семейного быта и духовной культуры, в том числе религии, мифологии и фольклористики.
Особенно велики заслуги Н. Ф. Мокшина в разработке проблем мордовской бинарности, макро- и микроконсолидационных процессов у мордвы, этноструктуры мордовского народа как одного из архогенетических народов Восточной Европы на различных этапах его истории, этногенетических, этнокультурных и этноконфессиональных связей мордвы, типологии мордовского этноса, мордовской историографии, в расширении и обогащении источниковой базы историко-этнографических исследований, в сборе этнографических материалов и коллекций для организованного им и открытого 19 декабря 1979 г. в Мордовском государственном университете этнографического музея.
По результатам исследований опубликовано более 800 научных и учебно-методических работ.