Важное место в работе кафедры цитологии, гистологии и эмбриологии с курсами медицинской биологии и молекулярной биологии клетки занимает научно-исследовательская деятельность по направлению «Морфология и фармакология органов сердечно-сосудистой и нервной систем». В рамках этого направления проводятся научные исследования по изучению морфологических изменений органов при различных стрессорных и патологических состояниях в эксперименте. Также изучается действие антиоксидантных лекарственных средств (эмоксипин, мексидол. креатинфосфат) и иммуномодуляторов (полиоксидоний) на морфологические изменения клеток, тканей и органов при адаптации животных к различным неблагоприятным факторам внешней среды. Заведующий кафедрой Балашов В.П. осуществляет руководство НИР студентов и аспирантов.

        По профилю сципеальности кафедры под его руководством защищено более 30 кандидатских и 4 - докторских диссертаций. Сотрудники кафедры регулярно выступают с результатами своих исследований на Межрегиональных, Всероссийских и международных конференциях.
За последние семь лет сотрудниками кафедры было подано 7 заявок на конкурсы грантов различного уровня. Одна из них – «Создание онлайн-курсов по тематике здравоохранения и медицинских наук [2020]» оказалась победителем конкурса. На кафедре систематически выполнялись хоз-договорные внебюджетные исследования.
        Все сотрудники кафедры являются членами научного общества анатомов, гистологов, эмбриологов России. Зав. кафедрой, профессор Балашов В.П. выполняет обязанности члена редакционной коллегии журнала «Морфологические ведомости».