В 1968 году на базе кафедры биохимии и физиологии растений биологического факультета был впервые организован курс медицинской биохимии. В штате курса было 5 сотрудников: зав. курсом профессор В. В. Соколовский, ст. преподаватель Т. Ф. Атянина, ассистенты Л. И. Игольникова и Н. В. Альба, ст. лаборант Р. Н. Савкина. В 1972 году курс медицинской биохимии вошел в структуру медицинского факультета при кафедре нормальной физиологии. Организатором курса медицинской биохимии являлась доцент Л. Я. Лабзина. Благодаря ее усилиям, организаторским способностям, связям с родственными кафедрами ведущих медицинских институтов страны, был оснащен и организован учебный процесс, определены методика преподавания дисциплины и направления научных исследований.

В 2013 году, в связи с организацией преподавания фармацевтической химии для студентов специальности Фармация, курс медицинской биохимии был переименован в курс биологической и фармацевтической химии. В целях совершенствования организационной структуры Медицинского института на основании решения ученого совета университета от 31 августа 2015 года курс биологической и фармацевтической химии был выведен из состава кафедры нормальной физиологии и организована кафедра биологической и фармацевтической химии с курсом организации и управления фармацией, которая стала выпускающей для студентов специальности «Фармация». С 2015 по 2021 год кафедру возглавляла Л. Я. Лабзина. С 2022 года кафедрой заведует доктор биологических наук, профессор Е. В. Громова.

С 2015 года кафедра является выпускающей по специальности 33.05.01 Фармация. В 2024 году сотрудниками кафедры совместно с коллегами Юридического института разработана основная образовательная программа по специальности 33.05.01 Фармация и специальности 40.05.02 Правоохранительная деятельность профиль Фармацевтическое право. По завершению обучения по данной программе выпускникам будет присвоено две квалификации: Провизор и Юрист.

Кафедра биологической и фармацевтической химии с курсом организации и управления фармацией расположена в корпусе № 13. Лаборатории оснащены современным оборудованием, видеоматериалами, методическими стендами. Организован компьютерный класс для проведения тестирования по основным разделам дисциплин и просмотра видеоматериалов. Помещения кафедры достаточны для проведения учебной, учебно-исследовательской и научной работы.

По базовому образованию, по уровню научно-педагогической подготовленности преподавательский состав кафедры соответствует требованиям и содержанию подготовки по преподаваемым дисциплинам. Преподаватели постоянно работают над повышением своей квалификации и педагогического мастерства, выступают на Всероссийских и международных конференциях.

Кафедра биологической и фармацевтической химии с курсом организации и управления фармацией обеспечивает преподавание следующих дисциплин: 1) «Биохимия» специальности 31.05.01 «Лечебное дело», «General Medicine» и 31.05.02 «Педиатрия"2) «Функциональная биохимия» — специальности 31.05.01 «Лечебное дело» 3) «Биологическая химия — биохимия полости рта» по специальности 31.05.03 «Стоматология» 4) «Биологическая химия» — по специальностям 33.05.01 «Фармация», 5) «Фармацевтическая химия» по специальности 33.05.01 «Фармация» 6) «Стандартизация качества лекарственных средств» — по специальности 33.05.01 «Фармация» 7) «Управление экономикой фармации» — по специальности 33.05.01 «Фармация» 8) «Медицинское и фармацевтическое товароведение» — по специальности 33.05.01 «Фармация» 9) «Фармацевтическое консультирование» — по специальности 33.05.01 «Фармация».

Сотрудники кафедры организуют учебную практику «Фармацевтическая пропедевтическая практика» и производственные практики «Практика по организации деятельности службы фармацевтического маркетинга и логистики в аптечных организациях», «Практика по управлению и экономике аптечных учреждений», «Практика по контролю качеств лекарственных средств», «Практика по фармацевтическому консультированию и информированию» для студентов специальности 33.05.01 Фармация. Практики проводятся на следующих базах: Акционерное общество «Биохимик» (договор № 7/2024 от 14.08.2024), Государственное унитарное предприятие Республики Мордовия «Фармация» (договор № 5/24 от 22.06.24), общество с ограниченной ответственностью «Росток» (договор № 8/24 от 08.11.2024).

Кафедра разработала актуальные программы по дисциплинам, фонды оценочных средств, on-line курсы «Физико-химические свойства белков и их значение в медицинской и фармацевтической практике» и «Фармакопейный анализ лекарственных веществ, производных изохинолина, тропана, пиперидина». В 2020 году сотрудниками был создан онлайн курс «Физико-химические свойства белков и их значение в медицинской и фармацевтической практике» для дистанционного обучения.

Содержание рабочих программ соответствует целям и задачам подготовки специалистов по специальностям «Лечебное дело», «Педиатрия», «Стоматология» и «Фармация» с учетом приоритетов высшего образования.

Активно проходит цифровизация учебного процесса с ведением канала в интернете. Сотрудниками кафедры составлены комплексные контрольные задания для проверки текущей успеваемости студентов, для контроля усвоения материала. Составлены ситуационные задачи, разработаны обучающие и контролирующие программы на компьютерах.

На кафедре ведется большая учебно-методическая работа. Сотрудниками кафедры подготовлено и издано более 80 учебных пособий, в том числе электронных, 15 учебных пособий с грифом УМО, являются соавторами 4 монографий.

Сотрудники кафедры активно занимаются научной работой. Сотрудниками кафедры опубликовано более 400 научных работ в центральной печати и в материалах международных конференций. Налажена связь с биохимическими лабораториями клинических больниц с целью совместного исследования биохимических показателей в биологических жидкостях у больных с различной патологией.