Кафедра фундаментальной химии и химической технологии Мордовского университета ведёт свою историю от химических подразделений, созданных в Мордовском педагогическом институте. В 1931 году была организована кафедра химии, а в 1935 году состоялся первый выпуск специалистов. В 1957 году педагогический институт был преобразован в Мордовский государственный университет им. Н. П. Огарёва. Естественный факультет стал химико-биологическим с двумя отделениями: химическим и химико-биологическим. Кафедру общей химии, в составе которой функционировала лаборатория аналитической химии, возглавил кандидат химических наук, доцент Ф. С. Стэфкин. В 1959 году кафедра общей химии переименована в кафедру неорганической и аналитической химии, которую в 1973 году возглавил к.х.н., доцент А. П. Соловьёв.

В 1961 году на базе методического объединения кафедры химии химико-биологического факультета была создана кафедра органической химии. Первым заведующим стал к.х.н., доцент В. Г. Костенко. В ранний период кафедра отличалась широким диапазоном учебно-методической работы: преподаватели читали не только курсы по профилю кафедры, но и физическую, коллоидную химию, химию высокомолекулярных соединений, химическую технологию. С 1963 года при кафедре начала действовать аспирантура. В 1965 году из состава кафедры была выделена кафедра биохимии и физиологии растений, а в 1967 году — кафедра физической химии. В том же году кафедру органической химии возглавил ученик академика И. Я. Постовского д.х.н., профессор Б. С. Танасейчук, который оставался на этом посту до 1986 года. Под его руководством начались работы по химии стабильных свободных радикалов. С 1986 по 2007 год кафедрой руководил профессор, д.х.н. В. Н. Шишкин, развивавший направление химии полибромароматических соединений. С 2007 по 2018 год заведующим кафедрой органической химии был профессор, д.х.н. В. А. Васин, под руководством которого изучались производные цикло- и бицикло[1.1.0]бутана. В 2018 году кафедру органической химии возглавил к.х.н., доцент С. Г. Кострюков, организовавший исследования в области химии целлюлозы и ее производных.

В 2018 году из состава кафедры органической химии была выделена базовая кафедра химии и технологии физиологически активных веществ, созданная по инициативе и при техническом содействии АО «Биохимик». Заведующим новой кафедры был назначен к.х.н., доцент А. В. Семёнов. Под его руководством начались исследования по дизайну, синтезу и изучению биологически активных азотсодержащих гетероциклов для фармации и биомедицины. Кафедра стала выпускающей по направлению подготовки 18.03.01 Химическая технология (профиль «Химическая технология синтетических биологически активных веществ, химико-фармацевтических препаратов и косметических средств»).

Параллельно развивалась кафедра неорганической и аналитической химии. В 1982 году в результате разделения кафедры общей и аналитической химии образованы две самостоятельные кафедры: общей и неорганической химии (зав. — к.х.н., профессор Л.Ф. Зюзина) и аналитической химии (зав. — к.х.н., доцент А.К. Осипов). В 2015 году кафедру общей и неорганической химии возглавил к.х.н., доцент А. В. Долганов. Под его руководством начались исследования в области электрохимии, водородной энергетики и электрокатализа, в частности — разработки безметалльных органических катализаторов для получения «зелёного» водорода. В 2018 году эти две кафедры вновь объединены в кафедру неорганической и аналитической химии под руководством А. В. Долганова; объединённая кафедра получила статус выпускающей по специальности 04.05.01 Фундаментальная и прикладная химия.

С 1 ноября 2024 года путём реорганизации кафедры органической химии и кафедры химии и технологии физиологически активных веществ с их присоединением к кафедре неорганической и аналитической химии образована кафедра фундаментальной химии и химической технологии. Руководителем объединённой кафедры назначен к.х.н., доцент А. В. Долганов.

С апреля 2026 года и.о. заведующего кафедрой является к.х.н., доцент А. В. Семёнов.

Таким образом, кафедра фундаментальной химии и химической технологии, сформированная в 2024 году, объединила богатые традиции и научные школы трёх предшествующих кафедр: кафедры неорганической и аналитической химии (ведущей начало с 1931 года), кафедры органической химии (с 1961 года) и кафедры химии и технологии физиологически активных веществ (с 2018 года). Объединённое подразделение выступает как крупный учебный, научный и практико-ориентированный центр в системе химического и химико-технологического образования Мордовского государственного университета им. Н. П. Огарёва, осуществляя подготовку кадров для фундаментальной науки, аналитической и органической химии, химической технологии, фармацевтической промышленности и смежных отраслей. В настоящее время кафедра является выпускающей по специальности 04.05.01 Фундаментальная и прикладная химия (профиль «Аналитическая химия»), направлениям подготовки 18.03.01 Химическая технология (профиль «Химическая технология синтетических биологически активных веществ, химико-фармацевтических препаратов и косметических средств»), 04.04.01 Химия (профиль «Органическая химия»), 18.04.01 Химическая технология (профиль «Дизайн, разработка и производство лекарственных средств»), а также базовой кафедрой АО «Биохимик» (входит в ГК «Промомед»). Кафедра обеспечивает преподавание химических дисциплин для широкого спектра специальностей и направлений, включая лечебное дело, педиатрию, фармацию, биоинженерию, биотехнологию, физику, строительство, электронику и другие, и отвечает за реализацию программы аспирантуры по группе научных специальностей 1.4 Химические науки («Аналитическая химия», «Органическая химия»).

На кафедре работают 22 штатных единицы профессорско-преподавательского состава (12 кандидатов химических наук, 1 кандидат педагогических наук) и 11 сотрудников учебно-вспомогательного персонала. Кафедра поддерживает научно-методические связи с Московским государственным университетом имени М. В. Ломоносова и Нижегородским государственным университетом им. Н. И. Лобачевского, Самарским, Саратовским и Ульяновским техническими университетами, а также тесные контакты с производством.